Здание возведено в 1748—1749 годах. Изначально здание называлось цейхгаузом, а с конца 18 века стало именоваться Инженерным деловым двором с цейхгаузами. Здание сохранилось без серьезных изменений. Фасады дома решены в стиле раннего барокко. Здесь располагались чертежная мастерская и цейхгауз Инженерной команды, которая занималась проведением в крепости ремонтных и строительных работ. Ныне размещаются музейные экспозиции.
Первоначально это был комплекс из двух корпусов: П-образного фортификационного дома и цейхгауза, разделенных двумя воротными проездами и образующих четырехугольный внутренний двор. В 1886 году воротный проезд со стороны главной аллеи (на северном фасаде) был застроен, а оба корпуса подведены под одну крышу, образовав единое строение.
В Инженерном доме располагались чертежная мастерская и цейхгауз Инженерной команды, которая занималась проведением в крепости ремонтных и строительных работ. В разное время здесь также размещался архив дел Инженерного департамента и жилые помещения для семейных нижних чинов крепостного Инженерного управления.
Фасады Инженерного дома решены в стилистике петровского (раннего) барокко. Стены, выкрашенные в терракотово-розовый цвет, оформлены рустованными лопатками. До начала 19 века здание покрывала высокая черепичная кровля со слуховыми окнами, в 1809-1811 годах была устроена железная кровля.
В 1960-1968 годах была проведена реставрация интерьера Инженерного дома по проекту архитектора-реставратора Ирины Бенуа, с целью приспособления его для выставок. По завершению работа в здании разместили постоянные и временные тематические экспозиции.
В настоящее время в Инженерном доме располагаются экспозиции Государственного музея истории Санкт-Петербурга.